Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HADHQ16836 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms