Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UPP1Q16831 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UPP1Q16831 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms