Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTF1Q16619 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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