Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F4Q16254 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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E2F4Q16254 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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E2F4Q16254 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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