Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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SNCBQ16143 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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