Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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NECTIN1Q15223 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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NECTIN1Q15223 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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NECTIN1Q15223 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECTIN1Q15223 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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