Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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