Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms