Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms