Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLCA4Q14CN2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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CLCA4Q14CN2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CLCA4Q14CN2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CLCA4Q14CN2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CLCA4Q14CN2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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CLCA4Q14CN2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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CLCA4Q14CN2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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