Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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