Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS1Q14691 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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