Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BECN1Q14457 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BECN1Q14457 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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