Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK13Q14004 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK13Q14004 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms