Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX2Q13950 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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