Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms