Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX3Q13761 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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