Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2Q13563 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2Q13563 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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