Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms