Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
AP3B2Q13367 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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