Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGADQ13349 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGADQ13349 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms