Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHAF1AQ13111 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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