Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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