Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMAN2Q12907 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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