Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BPTFQ12830 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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