Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms