Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF3C1Q12789 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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