Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GRIN1Q05586 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms