Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms