Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4GALNT1Q00973 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms