Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC5Q00444 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms