Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFA3P59666 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms