Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB25P57735 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms