Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP9P55211 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms