Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ME1P48163 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ME1P48163 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ME1P48163 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms