Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHI3L1P36222 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHI3L1P36222 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms