Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPDP35247 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPDP35247 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms