Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GCAP28676 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GCAP28676 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCAP28676 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCAP28676 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms