Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD10P28358 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD10P28358 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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