Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB5P28074 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms