Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APEX1P27695 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APEX1P27695 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX1P27695 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX1P27695 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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