Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PLNP26678 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PLNP26678 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms