Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT1P26358 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT1P26358 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms