Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPB42P16452 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms