Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL6A2P12110 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL6A2P12110 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms