Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD3P0DMS9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms