Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLBP06746 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLBP06746 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLBP06746 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLBP06746 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms