Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13BP05160 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13BP05160 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F13BP05160 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F13BP05160 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms