Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOA1P02647 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms