Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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